Thông Tư 89/2026/TT-BTC: Mẫu Tờ Khai Quyết Toán Thuế TNDN Mới

Thông tư 89/2026/TT-BTC thay thế toàn bộ Thông tư 80/2021/TT-BTC, có hiệu lực từ ngày 1/7/2026, ban hành mẫu tờ khai quyết toán thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) hoàn toàn mới — gồm Mẫu 03/TNDN, Mẫu 04/TNDN, Mẫu 05/TNDN và Mẫu 03-2/TNDN (phụ lục chuyển lỗ). Đây là thay đổi quan trọng mà mọi doanh nghiệp, đặc biệt doanh nghiệp FDI tại TP.HCM, phải nắm rõ trước khi lập hồ sơ quyết toán thuế TNDN năm 2026 (hạn nộp 31/3/2027), vì nộp sai mẫu có thể bị trả hồ sơ và kéo theo rủi ro chậm nộp.

Thông Tư 89/2026/TT-BTC Là Gì?

Thông tư 89/2026/TT-BTC là văn bản do Bộ Tài chính ban hành ngày 30/6/2026, hướng dẫn chi tiết thi hành Luật Quản lý thuế và Nghị định 252/2026/NĐ-CP về hồ sơ khai thuế, trong đó quy định lại toàn bộ hệ thống mẫu biểu kê khai thuế áp dụng trên cả nước.

Thông tư này thay thế Thông tư 80/2021/TT-BTC — văn bản đã được doanh nghiệp sử dụng liên tục trong 5 năm qua để kê khai, phân bổ và quyết toán các loại thuế, bao gồm thuế GTGT, thuế TNDN, thuế TNCN và các khoản thu khác. Việc ban hành Thông tư 89/2026/TT-BTC nhằm đồng bộ mẫu biểu với các quy định mới về quản lý thuế, số hóa hồ sơ và phân cấp quản lý thuế theo mô hình cơ quan thuế hai cấp.

Căn cứ pháp lý: Luật Quản lý thuế số 38/2019/QH14, Nghị định 252/2026/NĐ-CP, Thông tư 89/2026/TT-BTC (Bộ Tài chính).

Thông Tư 89/2026/TT-BTC Có Hiệu Lực Từ Khi Nào?

Thông tư có hiệu lực thi hành từ ngày 1/7/2026. Mọi hồ sơ khai thuế, bao gồm hồ sơ quyết toán thuế TNDN, phát sinh nghĩa vụ kê khai từ thời điểm này trở đi đều phải sử dụng mẫu mới theo Phụ lục I ban hành kèm Thông tư.

Điều này có nghĩa là hồ sơ quyết toán thuế TNDN cho cả năm tài chính 2026 (dù năm tài chính bắt đầu từ 1/1/2026, tức trước ngày thông tư có hiệu lực) vẫn phải lập theo mẫu mới, vì thời điểm nộp hồ sơ (chậm nhất 31/3/2027) rơi vào giai đoạn Thông tư 89/2026/TT-BTC đang có hiệu lực. Doanh nghiệp không được tiếp tục dùng mẫu cũ theo Thông tư 80/2021/TT-BTC cho kỳ quyết toán này.

Với các tờ khai tạm tính theo quý phát sinh trước 1/7/2026, doanh nghiệp vẫn dùng mẫu cũ cho các kỳ đã nộp; chỉ từ kỳ phát sinh sau mốc này mới áp dụng mẫu mới.

Ai Phải Áp Dụng Mẫu Tờ Khai Thuế TNDN Mới Theo Thông Tư 89/2026/TT-BTC?

Tất cả doanh nghiệp nộp thuế TNDN theo phương pháp doanh thu – chi phí tại Việt Nam đều phải áp dụng, không phân biệt doanh nghiệp FDI, doanh nghiệp 100% vốn trong nước, hay quy mô lớn nhỏ.

Cụ thể theo từng nhóm đối tượng:

• Doanh nghiệp kê khai theo phương pháp doanh thu – chi phí (đa số doanh nghiệp, kể cả công ty FDI): dùng Mẫu 03/TNDN.
• Doanh nghiệp, tổ chức nước ngoài kê khai theo tỷ lệ % trên doanh thu (thường là văn phòng đại diện, nhà thầu nước ngoài không đủ điều kiện hạch toán): dùng Mẫu 04/TNDN.
• Doanh nghiệp nhà nước chuyển nhượng vốn: dùng Mẫu 05/TNDN.
• Doanh nghiệp có số lỗ được chuyển từ các năm trước hoặc phát sinh lỗ trong kỳ (bao gồm lỗ sản xuất kinh doanh và lỗ chuyển nhượng bất động sản): bắt buộc kèm thêm Mẫu 03-2/TNDN.

Doanh nghiệp FDI tại TP.HCM đang hưởng ưu đãi thuế TNDN, có hoạt động chuyển giá hoặc chuyển lỗ nhiều năm cần rà soát kỹ phụ lục đi kèm, vì mẫu mới thay đổi cách trình bày chỉ tiêu so với mẫu cũ.

Mẫu 03/TNDN Và Mẫu 03-2/TNDN Có Gì Thay Đổi So Với Thông Tư 80/2021/TT-BTC?

Mẫu 03/TNDN và Mẫu 03-2/TNDN theo Thông tư 89/2026/TT-BTC sắp xếp lại các chỉ tiêu cho đồng bộ với hệ thống quản lý thuế mới, trong khi nguyên tắc tính thuế TNDN và nguyên tắc chuyển lỗ (chuyển liên tục, không quá 5 năm kể từ năm phát sinh lỗ) vẫn giữ nguyên theo Luật Thuế TNDN hiện hành.

Điểm khác biệt đáng chú ý trên Mẫu 03-2/TNDN mới: phụ lục chuyển lỗ được tách rõ thành hai phần độc lập — (1) lỗ của hoạt động sản xuất kinh doanh được chuyển trong kỳ và (2) lỗ của hoạt động chuyển nhượng bất động sản được chuyển trong kỳ. Việc tách bạch này giúp cơ quan thuế kiểm soát chặt hơn trường hợp doanh nghiệp bù trừ lỗ bất động sản vào lãi hoạt động kinh doanh chính — vốn không được phép theo quy định.

Ngoài ra, Mẫu 03/TNDN mới cũng điều chỉnh một số chỉ tiêu liên quan đến ưu đãi thuế và thu nhập khác để phù hợp với việc phân cấp quản lý thuế theo mô hình cơ quan thuế hai cấp đang triển khai từ năm 2026.

Quy Trình Nộp Hồ Sơ Quyết Toán Thuế TNDN 2026 Theo Mẫu Mới

Doanh nghiệp thực hiện theo 5 bước sau để đảm bảo hồ sơ quyết toán thuế TNDN năm 2026 đúng mẫu Thông tư 89/2026/TT-BTC:

1. Cập nhật phần mềm hỗ trợ kê khai (HTKK) hoặc phần mềm kế toán lên phiên bản hỗ trợ Mẫu 03/TNDN, 03-2/TNDN theo Thông tư 89/2026/TT-BTC trước khi lập tờ khai.
2. Tổng hợp số liệu kế toán năm 2026, xác định doanh thu, chi phí được trừ, thu nhập chịu thuế và số lỗ còn được chuyển (nếu có) từ các năm trước.
3. Lập tờ khai Mẫu 03/TNDN và các phụ lục đi kèm (ưu đãi thuế, chuyển lỗ Mẫu 03-2/TNDN, giao dịch liên kết nếu có) theo đúng form mới.
4. Nộp hồ sơ qua Cổng thông tin điện tử của Tổng cục Thuế chậm nhất ngày 31/3/2027 (đối với năm tài chính theo năm dương lịch).
5. Lưu trữ hồ sơ, chứng từ gốc tối thiểu 10 năm để phục vụ công tác kiểm tra, thanh tra thuế sau này.

Không Dùng Mẫu Mới Có Bị Phạt Không? Mức Phạt Cụ Thể

Cơ quan thuế có quyền từ chối hồ sơ nộp sai mẫu và yêu cầu nộp lại; nếu việc nộp lại khiến hồ sơ vượt thời hạn quyết toán, doanh nghiệp sẽ bị xử phạt vi phạm hành chính về chậm nộp hồ sơ khai thuế theo quy định hiện hành, cộng tiền chậm nộp 0,03%/ngày tính trên số thuế TNDN còn phải nộp.

Để tránh rủi ro này, doanh nghiệp nên: rà soát lại mẫu tờ khai đang dùng trên phần mềm kế toán/HTKK, đảm bảo đã cập nhật đúng phiên bản theo Thông tư 89/2026/TT-BTC trước khi đến gần hạn nộp 31/3/2027, đồng thời tham khảo ý kiến kiểm toán viên hoặc bộ phận tư vấn thuế nếu doanh nghiệp có giao dịch phức tạp như chuyển lỗ nhiều năm, ưu đãi thuế theo địa bàn/lĩnh vực.

So Sánh Thông Tư 89/2026/TT-BTC Và Thông Tư 80/2021/TT-BTC

Nếu doanh nghiệp đang chuẩn bị hồ sơ quyết toán thuế TNDN cuối năm 2026, nên kiểm tra song song quy định về chuyển lỗ trong thuế TNDN và thuế TNDN tạm tính theo quý để đối chiếu số liệu cho khớp giữa các kỳ tạm tính và quyết toán cuối năm.

Câu Hỏi Thường Gặp (FAQ)